Футбольный клуб «Вартекс» является профессиональным футбольным клубом из города Варяждин, Хорватия. Клуб был основан в 1931 году и выступает в Первой лиге Хорватии, втором по значимости футбольном дивизионе страны.
«Вартекс» дважды становился чемпионом Хорватии в сезонах 2001/02 и 2002/03, а также дважды выигрывал Кубок Хорватии в 2002 и 2004 годах. В 2002 году клуб также стал обладателем Суперкубка Хорватии.
В еврокубках «Вартекс» дебютировал в сезоне 2001/02, когда принял участие в розыгрыше Кубка УЕФА. В том сезоне клуб дошел до третьего квалификационного раунда, где уступил португальскому клубу «Витория» из Гимарайнша. В сезоне 2002/03 «Вартекс» снова участвовал в Кубке УЕФА и на этот раз добрался до группового этапа, где занял третье место в своей группе и не смог выйти в плей-офф.
В сезоне 2003/04 «Вартекс» принимал участие в Лиге чемпионов УЕФА. В первом квалификационном раунде клуб обыграл мальтийский клуб «Хибернианс», но во втором квалификационном раунде уступил итальянскому клубу «Милан».
В сезоне 2004/05 «Вартекс» участвовал в Кубке УЕФА, где дошел до первого раунда, где уступил немецкому клубу «Шальке 04».
В сезоне 2005/06 «Вартекс» снова участвовал в Лиге чемпионов УЕФА. В первом квалификационном раунде клуб обыграл армянский клуб «Пюник», но во втором квалификационном раунде уступил шведскому клубу «Юргорден».
В сезоне 2006/07 «Вартекс» участвовал в Кубке УЕФА, где дошел до первого раунда, где уступил французскому клубу «Страсбур».
В сезоне 2007/08 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял второе место и получил право на повышение в классе. В следующем сезоне клуб выступал в высшей лиге Хорватии, но занял последнее место и вылетел в Первую лигу.
В сезоне 2009/10 «Вартекс» снова выступал в Первой лиге Хорватии, где занял первое место и получил право на повышение в классе. В следующем сезоне клуб выступал в высшей лиге Хорватии, но занял предпоследнее место и снова вылетел в Первую лигу.
В сезоне 2011/12 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял седьмое место. В сезоне 2012/13 клуб выступал в Первой лиге Хорватии, где занял пятое место. В сезоне 2013/14 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял шестое место.
В сезоне 2014/15 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял шестое место. В сезоне 2015/16 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял седьмое место. В сезоне 2016/17 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял пятое место.
В сезоне 2017/18 «Вартекс» выступал в Первой лиге Хорватии, где занял третье место. В сезоне 2018/19 клуб выступал в Первой лиге Хорватии, где занял седьмое место.